Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYD88Q99836 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms