Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK5RAP2Q96SN8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP2Q96SN8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms