Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRAMP1Q96RY5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRAMP1Q96RY5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRAMP1Q96RY5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRAMP1Q96RY5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms