Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC17Q96LX7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms