Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SENP8Q96LD8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SENP8Q96LD8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms