Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD4Q96KN9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD4Q96KN9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms