Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKNOX2Q96KN3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKNOX2Q96KN3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms