Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VCPIP1Q96JH7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms