Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP3Q96JB5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms