Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms