Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CELF6Q96J87 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms