Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A3Q96HJ5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms