Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTV1Q96GA3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms