Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEIL1Q96FI4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEIL1Q96FI4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms