Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMO7Q8WWI1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO7Q8WWI1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms