Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSH3Q8TE77 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSH3Q8TE77 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms