Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MYRIPQ8NFW9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms