Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIBP1Q86W92 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP1Q86W92 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms