Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms