Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L1Q7RTZ2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L1Q7RTZ2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms