Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HECW1Q76N89 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HECW1Q76N89 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms