Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms