Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6P435 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q6P435 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q6P435 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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