Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms