Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM29Q5VYK3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM29Q5VYK3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms