Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRIP1Q5VSL9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRIP1Q5VSL9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms