Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDGFL1Q5TGJ6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms