Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFHC1Q5JVL4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EFHC1Q5JVL4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms