Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM74A3Q4VXF1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms