Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF4BQ2VIQ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF4BQ2VIQ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF4BQ2VIQ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF4BQ2VIQ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4BQ2VIQ3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4BQ2VIQ3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4BQ2VIQ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4BQ2VIQ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4BQ2VIQ3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF4BQ2VIQ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms