Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFX7Q2KHR2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms