Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2SQ16763 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2SQ16763 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms