Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RPE65Q16518 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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