Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS72Q15906 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS72Q15906 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
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