Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1EQ15878 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1EQ15878 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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