Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USF2Q15853 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USF2Q15853 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USF2Q15853 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USF2Q15853 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USF2Q15853 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
USF2Q15853 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
USF2Q15853 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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USF2Q15853 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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USF2Q15853 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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USF2Q15853 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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USF2Q15853 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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USF2Q15853 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USF2Q15853 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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