Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP3Q15836 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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