Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HMGN3Q15651 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMGN3Q15651 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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