Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRS1Q15050 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRS1Q15050 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
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