Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HERC3Q15034 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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