Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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NCAPHQ15003 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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NCAPHQ15003 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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NCAPHQ15003 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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NCAPHQ15003 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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NCAPHQ15003 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NCAPHQ15003 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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