Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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