Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CDK13Q14004 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDK13Q14004 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
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