Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NCOA4Q13772 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms