Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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