Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC1Q13547 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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