Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATMQ13315 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATMQ13315 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms