Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLN3Q13286 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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