Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
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