Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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NPRL3Q12980 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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NPRL3Q12980 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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NPRL3Q12980 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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NPRL3Q12980 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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NPRL3Q12980 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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NPRL3Q12980 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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NPRL3Q12980 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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NPRL3Q12980 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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